北京市京圃园生物工程有限公司是由北京市科委批准的高新技术企业。公司成立于1998年，依托中国农业科学院的技术优势，主要从事农业微生物、环保工程、土壤肥料、绿色农业种植等产业项目的技术开发及产品生产。目前公司拥有中高级技术人员16人。
1998年 京圃园生物工程有限公司注册成立，开始涉及生态农业领域。
1999年 公司专家队伍在造成我国农村主要污染物的畜禽粪便的无害化处理的研究上取得重大突破。采用微生物发酵技术，使之除臭，腐熟成为有机
农业种植所必需的高效、优质的生物有机肥。
2000年 有机废物发酵菌曲研制成功，并尝试运用特许加盟的方式带动下游产业的发展。
2001年 公司生产的“有机废物发酵菌曲”取得农业部颁发的登记证书，标志着我国发酵剂产品完全依赖进口的结束。
2002年 七月，全国人大副委员长姜春云视察“圃园”加盟企业，并对企业为现代农业生态 系统所做的贡献表示赞扬；十月，公司生产的“生物有机肥”成为首批取得农业部颁发登记证的产品。
2003年 “有机废物微生物发酵生产生物有机肥”技术通过了以国家环保总局金鉴明院士为专家委员会主任的成果鉴定，成为国内同行业中第一家具有知识产权并通过省部级鉴定的技术。
2004年 五月，公司承担国家级火炬计划项目“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术；七月，公司被批准为北京市高新技术企业；十月，“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术被评为北京市金桥奖项目。
2005年 三月，“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术被评为“2005年国家重点环境保护实用技术（A类）”；五月，公司承担国家级星火计划项目“有机废弃物微生物发酵剂及生物有机肥产业化开发”；十月，该项目荣获第二届中国??东盟博览会先进实用技术专题展优秀参展项目；十一月，该项成果通过国家环保总局环境保护科技成果登记。
2006年 该项技术被评为2005年国家环境保护科学技术奖。
2007年 “圃园”体系下已经发展全国各地40多家加盟企业，“圃园”生态农业体系初现规模。
2008年 公司在丹麦政府及丹麦驻华大使馆的支持下，与丹麦循环利用中心共同出资在中国组建了合资子公司。引进丹麦、德国先进技术处理中国污水，进军环保市场，从而进一步诠释了我公司“立足环保，面向农业”的发展理念。
