安徽省农业科学院作物研究所成立于1960年12月,位于合肥市西郊四里河。所内设置小麦、油菜、豆类、甘薯、栽培、花生、芝麻、品种资源利用、农业现代化共9个研究室和所办公室、试验示范中心、蒙城综合试验站。在职职工88人，其中高级职称26人。拥有新世纪百千万人才工程国家级人选1人、省级学术与技术带头人6人，学术技术带头人后备人选7人，博士15人，硕士23人，享受政府特殊津贴专家22人。在研作物全部进入国家现代农业产业技术体系，拥有岗位科学家3人，综合试验站站长5人。
作物研究所主要从事小麦、油菜、大豆、甘薯、玉米、花生、芝麻、食用豆、大麦等作物的遗传育种、耕作栽培和品种资源利用以及农业现代化研究工作，是安徽省和国家小麦、油菜、大豆、甘薯、芝麻等作物育种攻关的主要单位。建有“国家油料改良中心合肥油菜分中心”、“农业部优势
农作物科技创新中心”、“
农业部作物基因资源与种质创制科学观测试验站”、“安徽省农作物品质改良重点实验室”、“安徽省小麦体系研发中心”等科研平台。拥有固定资产1000余万元，各类用房3500m2，试验地20多公顷。拥有人工气候箱、近红外谷粒分析仪、蛋白质快速测定仪、气相色谱仪、进口小区收割机等先进仪器设备50余台（套），研究设备和技术手段先进，具有承担高新技术、应用基础理论研究等项目的能力。在优质油菜、高产小麦和夏大豆育种等领域居全国先进水平。2004年和2012年分别被科技部评为省属所级农林科研机构科技竞争力百强所，2007年列入安徽省首批“115”产业创新团队建设单位。在阜南、蒙城、龙亢、濉溪、五河等地建立科学试验示范基地16个，总面积近万亩。
“十五”以来，作物研究所共承担各类项目335余项，其中科技部课题62项。先后育成作物新品种60个，其中通过国家审定的品种15个，获国家植物新品种保护权16个。获得各类技术奖励18项，其中国家科技进步一等奖1项、国家技术发明奖二等奖1项，省部级科技奖励12项。获国家技术发明专利1项。育成品种在生产上累计推广面积上亿亩，创造出显著的社会经济效益。在省级以上刊物发表论文篇310，其中SCI论文10篇；参与或独立编写专著20部。共接待25个国家123人来所考察、讲学和科技交流；派出103人次前往28个国家进行考察访问、学术交流、技术培训和攻读博士学位.
